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存在数据库 - 在云中在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行existDB

这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一(例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器)在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令existDB

程序:

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存在数据库 - 管理存在数据库文件

概要


存在数据库 [-mersize 梅尔大小] -建立 一些.fasta 字首

存在数据库 -描述 字首

存在数据库 - 测试文件 一些.fasta 字首

存在数据库 -测试存在 一些.fasta

存在数据库 -测试详尽 一些.fasta 一些梅丽尔

商品描述


这个程序是 libkmer 的一部分。

配置


-mersize 梅尔大小
使用指定的 梅尔大小 建造时 存在数据库 表。

-建立 一些.fasta 字首
建立一个 存在数据库 在所有 mers 上 一些.fasta 并将表保存到 字首.

-描述 字首
报告一些状态 存在数据库 文件中。

- 测试文件 一些.fasta 字首
建立一个 存在数据库 表来自 一些.fasta. 将该表写入磁盘。 加载表
背部。 比较每个人在 一些.fasta 存在于所有三个 存在数据库
较早创建。

-测试存在 一些.fasta
建立一个 存在数据库 表来自 一些.fasta, 检查每个人 一些.fasta
在表中找到。 不保证表中的每个 mer 都在
文件中。

-测试详尽 一些.fasta 一些梅丽尔
建立一个 存在数据库 表来自 一些.fasta, 检查 _EVERY_ mer 是否存在。 抱怨
如果 mer 存在于表中但不存在于 梅丽尔(1) 数据库。 假设 一些梅丽尔
是 mercount 一些.fasta.

使用 onworks.net 服务在线使用existDB


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