这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 exonpairs,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
exonpairs - SNAP 模块 exonpairs
概要
外显子对 [选项]HMM 文件>FASTA 文件> [[选项]
配置
-min-内含子
最小内含子长度 [30]
-max-内含子
最大内含子长度 [10000]
-einit 长度
以 bp 为单位的最小 Einit 长度 [10]
-eterm-长度
以 bp 为单位的最小 Eterm 长度 [10]
-外显子长度
以 bp 为单位的最小外显子长度 [30]
-内含子分数 以位为单位的最小内含子分数 [-5]
-einit分数
以位为单位的最小 Einit 分数 [-5]
-eterm-分数
以位为单位的最低 Eterm 分数 [-5]
-外显子评分
以位为单位的最小外显子分数 [-5]
-对分数
最小配对分数(外显子-内含子-外显子)[10]
-侧面长度
每个外显子的侧翼序列长度 [20]
-lcmask
将小写字母视为 N
使用 onworks.net 服务在线使用 exonpairs
