这是命令 fastaq-trim_contigs,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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fastaq_trim_contigs - 从每个重叠群的末端修剪一定数量的碱基
商品描述
用法:fastaq_trim_contigs [选项]
从每个重叠群的末端修剪一定数量的碱基,因此间隙变得更大和重叠群
末端被移除。 碱基替换为 Ns。 任何以所有 N 结尾的序列都将丢失
阵地 参数:
infile 输入文件名
输出文件
输出文件名
可选 参数:
-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出
--trim_number TRIM_NUMBER 个
在每个间隙周围修剪的碱基数,以及每个序列的末端 [100]
使用 onworks.net 服务在线使用 fastaq-trim_contigs