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大蒜——分子可视化程序

概要

大蒜 [true 大蒜 选项[X11 选项[文件名]

商品描述

本手册页简要记录了 大蒜，一个免费的分子可视化程序。
可以在大蒜之家找到 HTML 格式的大量文档和来源，
<网址：http://garlic.mefos.hr/garlic/>. 物理位置：大学医学院
奥西耶克，克罗地亚，欧洲。 许多 GNU/Linux 发行版的预编译包
可用。 其中包括 Debian、SuSE、Mandriva、Linspire 和许多其他
发行版。 可以下载并解压 HTML 文档以供本地使用（推荐
用法）。 在这里你可以找到一个非常简短的程序描述和命令列表
线选项。

大蒜 是一个分子可视化程序，最初是为了研究
膜蛋白。 现在它可用于可视化和简单编辑所有蛋白质和
分子。 该版本识别PDB格式版本2.1； 查看源文件 pdb_atom.c
有关此格式的详细信息。

配置

命令行选项可以分为两组： true （具体的） 大蒜 选项 和 X11
选项. 可以按任何顺序给出选项。 所有选项和硬编码的默认值都是
列在下表中。 对于每个参数，通过命令行定义的值是
使用，如果可用。 如果不是，则定义在 .garlicrc 文件被使用。 如果 .garlicrc
文件不可用，或此文件中没有相应的条目，硬编码
使用默认值。 样品 .garlicrc 包含在原始包中的文件包含
值等于硬编码的默认值。

大蒜 opţiuni:
-H， - 帮帮我
打印帮助并退出。

-v， - 版
打印版本并退出。

-r, - 登记
注册大蒜：通知作者您的站点安装了大蒜并且有人
将要使用这个程序。 通过注册，您鼓励作者
继续发展大蒜。 您还可以帮助作者确保支持
进一步的发展。 此选项发送一封简短的电子邮件，仅包含
电子邮件消息标题和单词“嗨！”，到[电子邮件保护]>. 请
如果要使用此程序，请执行大蒜 -r。 如果您没有连接到
互联网，考虑从其他系统发送短消息。

-诺西斯 隐藏坐标系图标（左上角）。

-无控制
隐藏控制窗口（右上角）。

-立体声
显示立体图像。

-板 模式
默认平板模式。 可用的平板模式有：关闭、平面（默认）、球体、
半球体、圆柱体和半圆柱体。

-衰退 模式
默认颜色渐变模式。 可用模式：关闭、平面（默认）、球体、
半球体、圆柱体和半圆柱体。

-如 数
默认原子绘图样式（硬编码默认值：2）。

-bs 数
默认键绘图样式（硬编码默认值：2）。

-fs 数
褪色表面的默认数量。 平行平面、同心球或
同心圆柱体可用作褪色表面。 三个 RGB 三元组是
分配给每个表面。 表面均匀分布； 至少一个，至多
八要明确。 至少三种颜色（左、中、右）是
分配给每个可见原子。 这三种颜色是基于一个位置的
给定原子相对于最近的衰落表面和分配给的颜色
这些表面。 使用线性加权组合颜色。

-lc 颜色
在第 i 个表面留下的颜色； i 在零到七之间。 颜色字符串
应符合 X11R5。 例如，蓝色可以定义为蓝色或
RGB:0000/0000/FFFF 等 例如 -lc4 RGB:BBBB/8888/4444 定义左颜色
在索引等于 XNUMX 的表面上。

-mc 颜色
第 i 个表面的中间颜色。

-rc 颜色
第 i 个表面的正确颜色。

-个人电脑， --打印配置
打印配置数据并退出。

-PCN 将游标名称打印到标准输出并退出。

-日志 日志文件
将命令和消息写入日志文件。 该文件将在当前创建
工作目录。 如果这是不可能的，日志文件将在用户主页中创建
目录。

X11 选项​​：
-显示 显示名称
X服务器联系。

-几何学 几何
窗口几何（默认：几乎整个屏幕）。

-背景 颜色
主窗口背景颜色（默认为黑色）。

-fg 颜色
主窗口前景色（默认：白色）。

-fn 字体名
文字字体； （默认为 10x20）。

-tbg 颜色
文本背景颜色（默认为黑色）。

-tfg 颜色
文本颜色（默认为白色）。

-光标 游标名
光标名称； 看 /usr/include/X11/cursorfont.h 对于名字； 删除 XC_ 前缀。

使用 onworks.net 服务在线使用大蒜