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garniere - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 garniere

这是命令 garniere,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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garnier - 使用 GOR 方法预测蛋白质二级结构

概要


卡尼尔 -序列 后继 -idc 整数 -输出文件 报告

卡尼尔 -救命

商品描述


卡尼尔 是来自 EMBOSS(“欧洲分子生物学公开赛”)的命令行程序
软件套件”)。 它是“蛋白质:2D 结构”命令组的一部分。

配置


输入 部分
-序列 后继

先进的 部分
-idc 整数
在他们的论文中,GOR 提到如果你对二级结构有所了解
您正在分析的蛋白质的含量,您可以更好地进行预测。 'idc' 是一个
索引到一组数组 dharr[] 和 dsarr[],它们提供“决策常量”
(dch, dcs),这是应用于螺旋和片材权重的偏移量
(扩展)条款。 所以,idc=0 表示不使用决策常数偏移量,而 idc=1 到 6
表示应使用 dch,dcs 偏移的各种组合。

输出 部分
-输出文件 报告

使用 onworks.net 服务在线使用 garniere


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