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geneparse - 序列文件加载器前端

SYNAPSE

geneparse [options...] [input] [input2 ...] #读取输入并写入标准输出

商品描述

读取序列文件并将其写入某处（默认为标准输出）。

输入文件内的特定范围可以由 file[start,stop] 指定。 广场
括号可以互换为 {[()]} 中的任何一个，（例如“genome.fa[3000,4000]”或
“genome.fa{3000~4000}”）。 请注意，所有这些都可能被您的 shell 解析。 还
任何非单词字符都可用于分隔数字。

配置

--重复掩码|-r
使用软重复掩码序列（即：用 N 替换小写碱基）。

--上|--unmask|-U
大写所有碱基。

--长度|-l
只需打印长度并退出

--清洁|-c
完成后不要添加新行

--版本|-V
打印程序版本

--帮助|-h
打印帮助信息

--输出|-o
将输出发送到文件（否则使用标准输出）。 --output 意味着 --clean。

--安静|-q
使所有警告静音

--详细|-v
打印了很多额外的细节

使用 onworks.net 服务在线使用geneparse-mpi