这是 gmod_fasta2gff3.plp 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
$O - 将 FASTA 转换为简单的 GFF3
综合系统
% $O [选项]
命令行 配置
--fasta_dir 目录包含fasta文件
(默认:./fasta)
--gfffilename 要创建的 GFF3 文件的名称
(默认:./out.gff)
--type SO 类型分配给每个功能
(默认:EST)
--source 出现在源列中的文本
(默认: 。)
--attributes 额外的 tag=value 对出现在第 9 列
--nosequence 抑制 ##FASTA 部分(即,不要
打印 DNA 序列)
商品描述
这个脚本只需要一组 fasta 文件并将它们转换为简单的 GFF3
适合装入chado。
作者
斯科特凯恩[电子邮件保护]>
版权所有(c)2006
这个库是免费软件; 您可以在相同的目录下重新分发和/或修改它
术语作为 Perl 本身。
使用 onworks.net 服务在线使用 gmod_fasta2gff3.plp