这是 gmx-principal 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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gmx-principal - 计算一组原子的主轴惯性
概要
gmx 校长 [-f [<.xtc/.trr/...>][-s [<.tpr/.gro/...>]]
[-n [<.ndx>][.A1 [<.xvg>][.A2 [<.xvg>]]
[.A3 [<.xvg>][-om [<.xvg>][-b [-e ]
[-dt [tu [-[现在[-xvg ]
[-[不]foo]
商品描述
GMX 主要 计算一组原子的三个主轴惯性。 笔记：
旧版本的 GROMACS 以一种奇怪的转置方式写入输出数据。 自 GROMACS 起
5.0，输出文件 paxis1.dat 包含第一个（主要）的 x/y/z 分量
每个帧的主轴，类似地用于 paxis2.dat 中的中轴和次轴
和 paxis3.dat。
配置
指定输入文件的选项：
-f [<.xtc/.trr/...>] (traj.xtc)
弹道： 狂喜 TRR CPT 伟大 g96 资料库 TNG
-s [<.tpr/.gro/...>] （白杨.tpr）
结构+质量（db）： 时间 伟大 g96 资料库 断断续续
-n [<.ndx>] （索引.ndx） （可选）
索引文件
指定输出文件的选项：
.A1 [<.xvg>] （paxis1.xvg）
xvgr/xmgr 文件
.A2 [<.xvg>] （paxis2.xvg）
xvgr/xmgr 文件
.A3 [<.xvg>] （paxis3.xvg）
xvgr/xmgr 文件
-om [<.xvg>] (moi.xvg)
xvgr/xmgr 文件
其他选项：
-b (0)
从轨迹读取的第一帧 (ps)
-e (0)
从轨迹读取的最后一帧 (ps)
-dt (0)
仅在 t MOD dt = 第一次 (ps) 时使用帧
tu （PS）
时间值单位：fs、ps、ns、us、ms、s
-[现在 （否）
查看输出 .xvg, .xpm, .EPS 和 .pdb 档
-xvg
xvg 绘图格式：xmgrace、xmgr、无
-[不]foo （否）
避免空数组的虚拟选项
使用 onworks.net 服务在线使用 gmx-principal
