这是 gt-chseqids 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
gt-chseqids - 通过映射文件中给出的映射更改序列 ID。
概要
gt chseqids [选项...] mapping_file [GFF3_file]
商品描述
-种类 [是|否]
更改序列 ID 后对 GFF3 特征进行排序(内存消耗为
与输入文件大小成正比)(默认值:否)
-v [是|否]
详细(默认:否)
-o [文件名]
将输出重定向到指定文件(默认值:未定义)
-gzip [是|否]
写入 gzip 压缩输出文件(默认:无)
-bzip2 [是|否]
写入 bzip2 压缩输出文件(默认:无)
-力 [是|否]
强制写入输出文件(默认值:否)
-救命
显示帮助并退出
-版
显示版本信息并退出
mapping_file 的文件格式:
提供的映射文件定义了一个名为“chseqids”的映射表。 它映射
GFF3_file 中给其他名称的序列区域条目。 它可以定义为
如下:
chseqid = {
chr1 = "seq1",
chr2 = "seq2"
}
使用此示例时,所有序列 ID“chr1”都将更改为“seq1”,并且所有
序列 ID“chr2”到“seq2”。
REPORTING BUGS
将错误报告给[电子邮件保护]>.
使用 onworks.net 服务在线使用 gt-chseqids