这是 gt-eval 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
gt-eval - 比较注释文件并显示准确性度量(预测与参考)。
概要
gt 评估 参考文件预测文件
商品描述
-nuc [是|否]
评估核苷酸级别(内存消耗与输入文件大小成正比)
(默认:是)
-ltr [是|否]
评估 LTR 逆转录转座子预测而不是基因预测(所有
LTR_retrotransposon 元素被认为具有未确定的链)(默认:
不要)
-三角洲 [折扣值]
将 LTR 边界的允许增量设置为相等(默认值:20)
-v [是|否]
详细(默认:否)
-o [文件名]
将输出重定向到指定文件(默认值:未定义)
-gzip [是|否]
写入 gzip 压缩输出文件(默认:无)
-bzip2 [是|否]
写入 bzip2 压缩输出文件(默认:无)
-力 [是|否]
强制写入输出文件(默认值:否)
-救命
显示帮助并退出
-版
显示版本信息并退出
该程序显示某些特征类型的敏感性和特异性值(例如,
基因、mRNA 和外显子)。 对于某些特征类型,缺失和错误特征的数量
还显示了该类型。 因此,“缺失”意味着该类型特征的数量来自
与“预测”中的该类型特征没有重叠的“参考”。 副
相反,“错误”表示来自“预测”的该类型特征的数量,而没有
从“参考”重叠到该类型的特征。
REPORTING BUGS
将错误报告给[电子邮件保护]>.
使用 onworks.net 服务在线使用 gt-eval