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idconvert - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 idconvert

这是 idconvert 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


身份转换 — 转换质谱鉴定文件格式。

概要


身份转换 [选项] [文件掩码]

商品描述


本手册页简要记录了 身份转换 软件在 libpwiz 工具
包裹。 该程序允许人们转换质谱蛋白质鉴定数据
文件从一种格式转换为另一种格式。

配置


-v | --详细
显示详细的处理进度信息。

-f | --文件列表 文件名
使用的内容 文件名 其中列出了文件名。

-o | --outdir DIR
将输出目录('-' 表示 stdout)设置为 DIR. 默认情况下,输出
目录是“.” (即当前工作目录)。

-c | --配置 文件名
将配置文件设置为 文件名.

-e | - ext 分机
将输出文件的扩展名设置为 分机. 可以是 mzid 或 pepXML 或 txt。

--mzIdentML
填写 mzidentml 格式(默认)。

--pepXML 写入 pepXML 格式。

--text 写分层 文本 格式。

示例


将 sequest.pepXML 转换为 sequest.mzid

身份转换 sequest.pepXML

将 mascot.mzid 转换为 mascot.pepXML

身份转换 吉祥物.mzid --pepXML

使用配置文件

身份转换 xtandem.pep.xml -c config.txt

返回 VALUE


失败的文件数。

使用 onworks.net 服务在线使用 idconvert


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