这是 kmc_tools-intersect 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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kmc_tools-intersect - 计算两个 KMC 数据库的交集
概要
kmc_工具 相交 <output
[输出参数]>
商品描述
输出数据库将仅包含两个输入集中都存在的 k-mer。 这
输出数据库中的计数器值等于输入中的较低计数器值。
配置
每个输入都有额外的参数:
-ci
排除 k-mers 发生少于次
-cx
排除 k-mers 出现的次数超过次
对于输出,还有其他参数:
-ci
排除 k-mers 发生少于次
-cx
排除 k-mers 出现的次数超过次
-CS
计数器的最大值
例
kmc -k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools 相交 kmers1 -ci10 -cx200 kmers2 -ci4 -cx100 kmers1_kmers2_intersect -ci20 -cx150
使用 onworks.net 服务在线使用 kmc_tools-intersect