这是 last-dotplot 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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last-dotplot - 制作一个点图,又名牛津网格,以 LAST 表格格式对齐
概要
最后点图 - 帮帮我
最后点图 [选项] maf 或制表符对齐 点图.png
最后点图 [选项] maf 或制表符对齐 点图.gif
...
商品描述
以 MAF 或表格格式绘制成对序列比对的点图。
配置
-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出
-1 图案, --seq1=模式
从第一个基因组中显示哪些序列
-2 图案, --seq2=模式
从第二个基因组中显示哪些序列
-x 宽度, - 宽度=宽度
以像素为单位的最大宽度(默认值:1000)
-y 高度, - 高度=高度
以像素为单位的最大高度(默认值:1000)
-f 文件, --字体文件=文件
TrueType 或 OpenType 字体文件
-s 尺寸, - 字体大小=尺寸
TrueType 或 OpenType 字体大小(默认值:11)
-c 颜色, --前向颜色=颜色
前向对齐的颜色(默认值:红色)
-r 颜色, --反色=颜色
反向对齐的颜色(默认值:蓝色)
无序间隙选项:
--间隙1=文件
从 agp 或 gap 文件读取基因组 1 未排序的间隙
--间隙2=文件
从 agp 或 gap 文件读取基因组 2 未排序的间隙
--桥接颜色=颜色
桥接间隙的颜色(默认:黄色)
--unbridged-颜色=颜色
未桥接间隙的颜色(默认:粉红色)
使用 onworks.net 服务在线使用 last-dotplot