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last-pair-probs - 读取配对 DNA 读数与基因组的比对,并进行估计
概要
最后一对问题 [选项] 交错对齐
最后一对问题 [选项] 对齐方式1 对齐方式2
商品描述
读取配对 DNA 读数与基因组的比对,并且:(1)估计分布
配对读数之间的距离,(2)估计每个比对的概率
代表读取的基因组来源。
配置
-h, - 帮帮我
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-r, --rna
假设读数来自潜在剪接的 RNA
-e, --estdist
只估计距离的分布
-m M, --错误映射=M
不要写错图概率 > M 的对齐(默认值:0.01)
-f BP ——弗拉格伦=BP
以 bp 为单位的平均距离
-s BP --sdev=BP
距离标准差
-d 概率, --不相交=PROB
不相交映射的先验概率(默认值:0.02,如果 -r, 否则 0.01)
-c 铬, - 圆=铬
指定染色体 CHROM 是圆形的(默认值:chrM)
-V, - 版
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