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last-pair-probs - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 last-pair-probs

这是 last-pair-probs 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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last-pair-probs - 读取配对 DNA 读数与基因组的比对,并进行估计

概要


最后一对问题 [选项] 交错对齐

最后一对问题 [选项] 对齐方式1 对齐方式2

商品描述


读取配对 DNA 读数与基因组的比对,并且:(1)估计分布
配对读数之间的距离,(2)估计每个比对的概率
代表读取的基因组来源。

配置


-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出

-r, --rna
假设读数来自潜在剪接的 RNA

-e, --estdist
只估计距离的分布

-m M, --错误映射=M
不要写错图概率 > M 的对齐(默认值:0.01)

-f BP ——弗拉格伦=BP
以 bp 为单位的平均距离

-s BP --sdev=BP
距离标准差

-d 概率, --不相交=PROB
不相交映射的先验概率(默认值:0.02,如果 -r, 否则 0.01)

-c 铬, - 圆=
指定染色体 CHROM 是圆形的(默认值:chrM)

-V, - 版
显示程序的版本号并退出

使用 onworks.net 服务在线使用 last-pair-probs


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