这是命令 loadPulses,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
loadPulses - 加载排序脉冲信息
概要
负载脉冲 bas文件名 文件名 [选项]
商品描述
负载脉冲 加载排序脉冲信息,例如脉冲间距离或质量
cmp.h5 文件中的信息。 这允许人们分析动力学和质量
对齐列的信息。
配置
bas文件名
输入 {bas,pls}.h5 或 input.fofn。
文件名
用于加载脉冲信息的 cmp.h5 文件。
-指标 折扣值
逗号分隔的指标列表(没有空格)。
有效的选项是:
WhenStarted、QualityValue、InsertionQV、MergeQV、DeletionQV、DeletionTag、
SubstitutionTag、SubstitutionQV、PreBaseFrames、IPD、StartFrame、PulseWidth、
WidthInFrames、Light、pkmid、ClassifierQV、PulseIndex
默认选项是:
QualityValue、ClassifierQV、StartFrame、PulseWidth、WidthInFrames、pkmid、
IPD
-失败丢失数据
如果 bas.h5 或 pls.h5 输入中缺少任何数据字段,则退出
需要加载指标。 默认是一个警告。
-byread
通过读取而不是缓冲指标加载脉冲信息。
-通过度量
按度量而不是读取加载脉冲信息。 这比
-byread,但可以更快。
-最大元素 折扣值
设置要缓冲的 pls/bas 文件的大小限制 -通过度量 (默认值:
最大整数)。 用 -byread 如果超过限制。
-max内存 折扣值
在内存上设置限制(以 GB 为单位)以缓冲数据 -通过度量 (默认值:4
GB)。 用 -byread 如果超过限制。
-metaN元素 折扣值
设置元数据缓存中用于读取 bas/bax/pls.h5 文件的元素数。
-rawN 元素折扣值
设置原始数据缓存中用于读取 bas/bax/pls.h5 文件的元素数。
-rawChunkSize 折扣值
设置用于读取 bas/bax/pls.h5 文件的原始数据缓存的块大小。
使用 onworks.net 服务在线使用 loadPulses