这是 macs2_refinepeak 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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macs2_refinepeak - 基于模型的 ChIP 测序分析
商品描述
用法：macs2 精炼峰 [-h] -b 床单 -i IFILE [I文件...]
[-f {自动、BAM、SAM、BED、ELAND、ELANDMULTI、ELANDEXPORT、领结}]
[-c CUTOFF] [-w WINDOWSIZE] [--verbose VERBOSE] [--outdir OUTDIR] (-o 文件 |
--o-前缀 前缀）
可选 参数：
-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出
-b 床单
BED 格式的候选峰文件。 必需的。
-i IFILE [IFILE ...]， --i文件 IFILE [I文件...]
ChIP-seq 比对文件。 如果多个文件被指定为“-t AB C”，那么它们将
全部阅读并合并。 请注意，对端数据不应该与此一起使用
命令。 必需的。
-f {AUTO，BAM，SAM，BED，ELAND，ELANDMULTI，ELANDEXPORT，BOWTIE} - 格式
{汽车、BAM、SAM、BED、ELAND、ELANDMULTI、ELANDEXPORT、领结}
标签文件的格式，“AUTO”、“BED”或“ELAND”或“ELANDMULTI”或“ELANDEXPORT”或
“SAM”或“BAM”或“BOWTIE”。 默认的 AUTO 选项会让 'macs2 精炼峰'
决定文件是哪种格式。 请检查 README 文件中的定义，如果您
选择 ELAND/ELANDMULTI/ELANDEXPORT/SAM/BAM/BOWTIE。 默认：“自动”
-c 隔断， - 隔断 隔断
截止默认值：5
-w 窗口大小， --窗口大小 窗口大小
山顶两侧扫描窗口大小（默认：100bp）
--详细 详细
设置详细级别。 0：只显示关键信息，1：显示附加警告
消息，2：显示进程信息，3：显示调试消息。 如果你想知道
重复读取在哪里，使用 3. DEFAULT:2
--outdir 外向
如果指定，则所有输出文件都将写入该目录。 默认值：
当前工作目录
-o 文件， --o文件 文件
输出文件名。 与互斥 --o-前缀.
--o-前缀 前缀
输出文件前缀。 与互斥 -o/--文件。
使用 onworks.net 服务在线使用 macs2_refinepeak
