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mia-3dpropose-boundingbox - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 mia-3dpropose-boundingbox

这是命令 mia-3dpropose-boundingbox,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

名称


mia-3dpropose-boundingbox - 评估图像的边界框。

概要


mia-3dpropose-boundingbox -i [选项]

商品描述


mia-3dpropose-boundingbox 这个程序评估一个包含所有像素的框
给定的蒙版图像。 如果输入图像不是二值图像,则必须应用预过滤器
将输入图像转换为掩码。

配置


文件IO
-i --in-file=(输入,必填); io
要过滤的输入图像 有关支持的文件类型,请参阅
插件:3dimage/io

帮助 & 详细信息
-V --verbose=警告
输出的详细程度,打印给定级别和更高优先级的消息。
从最低级别开始支持的优先级是:
info - 低级消息
追踪 - 函数调用跟踪
失败 - 报告测试失败
警告 - 警告
错误 - 报告错误
调试 - 调试输出
message - 普通消息
致命 - 只报告致命错误

- 版权
印刷版权信息

-h --帮助
打印此帮助

-? - 用法
打印一个简短的帮助

- 版
打印版本号并退出

参数
-f --过滤器=
在评估边界框之前应用于图像的过滤器。 必须
返回一个位值 image.Filter 应用于图像之前
边界框被评估。 必须返回位值图像。 对于支持
插件见PLUGINS:3dimage/filter

-p --padding=0; 输入 [0, inf)
边界填充。

加工
--线程=-1
用于处理的最大线程数,这个数字应该更低
或等于机器中逻辑处理器内核的数量。 (-1:
自动估计)。用于处理的最大线程数,这
number 应该小于或等于逻辑处理器内核的数量
机器。 (-1:自动估计)。

插件: 1d/空间内核


差价 使用中心差分滤波器内核,镜像边界条件。

(无参数)

高斯 空间高斯滤波器核,支持的参数有:

w = 1; 输入 [0, inf)
滤波器宽度的一半。

插件: 1d/样条bc


镜子 在边界上镜像的样条插值边界条件

(无参数)

重复 在边界处重复值的样条插值边界条件

(无参数)

样条插值边界条件假设外部值为零

(无参数)

插件: 一维/样条内核


样条 B-spline kernel创建,支持的参数有:

d = 3; [0, 5] 中的整数
样条度数。

妈妈们 OMoms-spline 内核创建,支持的参数有:

d = 3; [3, 3] 中的整数
样条度数。

插件: 3dimage/组合器


绝对差异 图像组合器“absdiff”

(无参数)

图像组合器“添加”

(无参数)

DIV 图像组合器“div”

(无参数)

MUL 图像组合器“mul”

(无参数)

图像组合器“子”

(无参数)

插件: 3d图像/过滤器


带通 强度带通滤波器,支持的参数有:

最大 = 3.40282e+38; 漂浮
带的最大值。

分钟 = 0; 漂浮
带的最小值。

二值化 图像二值化过滤器,支持的参数有:

最大 = 3.40282e+38; 漂浮
可接受范围的最大值。

分钟 = 0; 漂浮
可接受范围的最小值。

关闭 形态接近,支持的参数有:

暗示 = 黑色; 细绳
主要图像内容的提示(黑色|白色)。

塑造 = [球体:r=2]; 工厂
结构元素。 有关支持的插件,请参阅 PLUGINS:3dimage/shape

组合 使用给定的组合器运算符组合两个图像。 如果“反向”设置为
false,第一个操作符是通过过滤器管道的图像,以及
第二个图像是从带有“图像”参数的文件中加载的
过滤器运行时,支持的参数是:

图片 =(输入,必填,字符串)
组合器中需要的第二个图像。

op =(必需,工厂)
要应用于图像的图像组合器。 有关支持的插件,请参阅
插件:3dimage/combiner

反转 = 0; 布尔值
反转图像传递到组合器的顺序。

兑换 图片像素格式转换滤镜,支持的参数有:

a = 1; 漂浮
线性转换参数 a.

b = 0; 漂浮
线性转换参数 b.

地图 = 选择; 字典
转换映射。 支持的值是:
选择 - 应用线性变换,将实际输入范围映射到
全输出范围
范围 - 应用映射输入数据类型的线性变换
范围到输出数据类型范围
复制 - 转换时复制数据
线性 - 应用线性变换 x -> a*x+b
选择状态 - 应用基于输入均值和映射的线性变换
变化到整个输出范围

代表 = 字节; 字典
输出像素类型。 支持的值是:
没有 - 没有定义像素类型
浮动 - 浮点 32 位
字节 - 有符号的 8 位
乌龙 - 无符号 64 位
翻番 - 浮点 64 位
- 有符号的 32 位
超短 - 无符号 16 位
- 有符号的 16 位
UINT - 无符号 32 位
漫长的 - 有符号的 64 位
- 二进制数据
字节 - 无符号 8 位

作物 裁剪图像的一个区域,该区域始终夹在原始图像上
大小在保持给定范围的意义上。支持的参数是:

结束 = [[4294967295,4294967295,4294967295]]; 流媒体
裁剪范围结束,最大值 = (-1,-1,-1)。

开始 = [[0,0,0]]; 流媒体
种植范围的开始。

膨胀 3d图像堆栈扩张过滤器,支持的参数有:

暗示 = 黑色; 细绳
主要图像内容的提示(黑色|白色)。

塑造 = [球体:r=2]; 工厂
结构元素。 有关支持的插件,请参阅 PLUGINS:3dimage/shape

距离 评估图像的 3D 距离变换。 如果图像是二值掩码,
那么每个点的距离变换结果对应于欧几里得
到面罩的距离。 如果输入图像是标量像素值,则
这个标量被解释为高场,每像素值添加到
距离。

(无参数)

缩小规模 通过使用给定的块大小来定义缩小比例来缩小输入图像
因素。 在缩放图像之前通过平滑过滤器过滤到
消除高频数据并避免混叠伪影。,支持
参数是:

b = [[1,1,1]]; 3d边界
块大小。

bx = 1; 输入 [1, inf)
x 方向的块大小。

by = 1; 输入 [1, inf)
y 方向的块大小。

bz = 1; 输入 [1, inf)
z 方向的块大小。

核心 = 高斯; 细绳
应用平滑滤波器核,估计滤波器的大小
基于块大小..

侵蚀 3d图像堆栈侵蚀过滤器,支持的参数有:

暗示 = 黑色; 细绳
主要图像内容的提示(黑色|白色)。

塑造 = [球体:r=2]; 工厂
结构元素。 有关支持的插件,请参阅 PLUGINS:3dimage/shape

高斯 各向同性 3D 高斯滤波器,支持的参数有:

w = 1; int in [0, inf)
过滤器宽度参数。

研究生 3D 图像到梯度范数滤波器

(无参数)

成长面具 使用输入的二进制掩码和参考灰度图像进行区域增长
通过添加已经添加的像素的邻域像素,如果
高于给定阈值的强度,支持的参数是:

分钟 = 1; 漂浮
面具生长的门槛较低。

文献 =(输入,必填,字符串)
掩模区域生长的参考图像。

塑造 = 6n; 工厂
邻里面具。 有关支持的插件,请参阅 PLUGINS:3dimage/shape

颠倒 强度反转滤波器

(无参数)

异体素 此过滤器缩放图像,使体素大小等距,其大小为
对应给定值,支持的参数有:

插曲 = [bspline:d=3]; 工厂
要使用的插值内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinekernel

尺寸 = 1; 浮在 (0, inf)
等距目标体素大小。

均值 3D 图像 k 均值滤波器。 在输出图像中,像素值代表
班级成员和班级中心作为属性存储在图像中。,
支持的参数有:

c = 3; int in [2, inf)
班级数。

标签 用于标记二值图像的连接组件的过滤器。,支持
参数是:

n = 6n; 工厂
邻里面具。 有关支持的插件,请参阅 PLUGINS:3dimage/shape

标签图 用于重新映射标签 ID 的图像过滤器。 仅适用于整数值的图像
强度/标签。,支持的参数是:

地图 =(输入,必填,字符串)
标签映射文件。

标签量表
仅创建已在输入中创建的输出体素的过滤器
图片。 缩放是通过使用选择目标的投票算法完成的
像素值基于某个标签的最高像素数
对应的源区。 如果区域包含两个相同的标签
计数,数字较小者获胜,支持的参数有:

大尺寸 =(必需,3dbounds)
目标大小作为两个彗形分隔值给出。

加载 从文件加载输入图像并用它替换当前图像
管道,支持的参数有:

文件 =(输入,必填,字符串)
要从中加载的输入文件的名称..

lvdownscale
这是一个标签投票缩减过滤器。 它按块缩小 3D 图像。
对于每个块,块中出现次数最多的(非零)标签是
作为目标图像中的输出像素发出。 如果两个标签出现相同的数字
有时,绝对值较小者胜出,支持的参数有:

b = [[1,1,1]]; 3d边界
用于缩小的块大小。 每个块将由一个像素表示
在目标图像中..

面膜 遮罩一张图片,一张图片取自参数列表,另一张取自
普通滤波器输入。 两张图片的尺寸必须相同,并且一张图片必须
是二进制的。 通过过滤器管道的图像的属性是
保存。 输出像素类型对应的输入图像不是
二进制,支持的参数有:

输入 =(输入,必填,字符串)
第二个输入图像文件名。

意味着 3D图像均值滤波器,支持的参数有:

w = 1; int in [1, inf)
滤波器宽度的一半。

中位数 中值 3d 过滤器,支持的参数有:

w = 1; int in [1, inf)
过滤器宽度参数。

毫升 Mean of Least Variance 3D image filter,支持的参数有:

w = 1; int in [1, inf)
过滤器宽度参数。

归一化器
3D图像mean-sigma归一化滤波器,支持的参数有:

w = 1; int in [1, inf)
滤波器宽度的一半。

打开 形态开放,支持的参数有:

暗示 = 黑色; 细绳
主要图像内容的提示(黑色|白色)。

塑造 = [球体:r=2]; 工厂
结构元素。 有关支持的插件,请参阅 PLUGINS:3dimage/shape

重新定向 3D图像重定向滤镜,支持的参数有:

地图 = xyz; 字典
要应用的方向映射。 支持的值是:
p-zxy - 置换 x->y->z->x
r-x180 - 绕 x 轴顺时针旋转 180 度
XYZ - 保持方向
yzx - 置换 x->z->y->x
r-z180 - 绕z轴顺时针旋转180度
r-y270 - 绕y轴顺时针旋转270度
f-xz - 翻转 xz
f-yz - 翻转 yz
r-x90 - 绕 x 轴顺时针旋转 90 度
r-y90 - 绕y轴顺时针旋转90度
r-x270 - 绕 x 轴顺时针旋转 270 度
r-z270 - 绕z轴顺时针旋转270度
r-z90 - 绕z轴顺时针旋转90度
f-xy - 翻转 xy
r-y180 - 绕y轴顺时针旋转180度

调整 调整图像大小。 原始数据在新尺寸的图像内居中。,
支持的参数有:

尺寸 = [[0,0,0]]; 流媒体
图像的新大小 大小 0 表示保持图像的大小
对应维度..

沙普 盐和胡椒3d过滤器,支持的参数有:

脱粒 = 100; 浮动在 [0, inf)
阈值。

w = 1; int in [1, inf)
过滤器宽度参数。

规模 缩放到给定目标大小的 3D 图像过滤器,支持的参数有:

插曲 = [bspline:d=3]; 工厂
要使用的插值内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinekernel

s = [[0,0,0]]; 3d边界
一次设置所有组件的目标大小(组件 0:使用输入图像
尺寸)。

sx = 0; 输入 [0, inf)
x 方向的目标大小(0:使用输入图像大小)。

sy = 0; 输入 [0, inf)
y 方向的目标大小(0:使用输入图像大小)。

sz = 0; 输入 [0, inf)
y 方向的目标大小(0:使用输入图像大小)。

选择大 创建一个表示最高强度的二进制掩码的过滤器
像素计数。像素值 0 将被忽略,如果两个强度有
相同的像素数,则结果未定义。 输入像素必须有一个
积分像素类型。

(无参数)

sepconv 3D图像强度分离卷积滤波器,支持的参数有:

kx = [高斯:w=1]; 工厂
在 x 方向过滤内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/空间内核

ky = [高斯:w=1]; 工厂
在 y 方向上过滤内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/空间内核

kz = [高斯:w=1]; 工厂
z 方向的滤波器内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/空间内核

SWS 种子水源。 该算法提取的区域正好与初始区域一样多
标签在种子图像中给出。支持的参数是:

毕业 = 0; 布尔值
将输入图像解释为渐变。 .

标记 = 0; 布尔值
用特殊的灰度值标记分段的流域。

n = [球体:r=1]; 工厂
水源区生长的邻域。 有关支持的插件,请参阅
插件:3dimage/shape

种子 =(输入,必填,字符串)
包含初始区域标签的种子输入图像。

开球 将输入图像保存到文件中,并将其传递给下一个过滤器,
支持的参数有:

文件 =(输出,必需,字符串)
输出文件的名称也保存图像..

变薄 3D 形态细化,基于:Lee 和 Kashyap,'Building Skeleton Models
通过 3-D 中间表面/轴细化算法、图形模型和图像
处理中 56(6):462-478, 1994。这个实现只支持 26
邻里。

(无参数)

改造 使用给定的变换变换输入图像。,支持的参数
是:

文件 =(输入,必填,字符串)
包含转换的文件的名称..

图像边界 =; 细绳
覆盖图像插值边界条件。

图像内核 =; 细绳
覆盖图像插值器内核。

方差 3D图像方差过滤器,支持的参数有:

w = 1; int in [1, inf)
滤波器宽度的一半。

ws 基本水源分割,支持的参数有:

评价 = 0; 布尔值
如果输入图像不代表梯度范数图像,则设置为 1。

标记 = 0; 布尔值
用特殊的灰度值标记分段的流域。

n = [球体:r=1]; 工厂
水源区生长的邻域。 有关支持的插件,请参阅
插件:3dimage/shape

脱粒 = 0; 浮动在 [0, 1)
相对梯度范数阈值。 实际值阈值为
阈值 * (max_grad - min_grad) + min_grad。 由梯度分隔的盆地
将加入较低的规范。

插件: 二维图像/IO


分析 分析 7.5 图像

可识别的文件扩展名:.HDR、.hdr

支持的元素类型:
无符号 8 位,有符号 16 位,有符号 32 位,浮点 32 位,
浮点 64 位

数据池 与内部数据池之间的虚拟 IO

可识别的文件扩展名:.@

迪康 Dicom 图像系列作为 3D

可识别的文件扩展名:.DCM、.dcm

支持的元素类型:
有符号 16 位,无符号 16 位

HDF5 HDF5 3D图像IO

可识别的文件扩展名:.H5、.h5

支持的元素类型:
二进制数据,有符号 8 位,无符号 8 位,有符号 16 位,无符号 16 位,
有符号 32 位、无符号 32 位、有符号 64 位、无符号 64 位、浮动
点 32 位,浮点 64 位

因里亚 INRIA 图像

可识别的文件扩展名:.INR、.inr

支持的元素类型:
有符号 8 位、无符号 8 位、有符号 16 位、无符号 16 位、有符号 32
位、无符号 32 位、浮点 32 位、浮点 64 位

MHD MetaIO 3D 图像 IO 使用 VTK 实现(实验性)。

可识别的文件扩展名:.MHA、.MHD、.mha、.mhd

支持的元素类型:
有符号 8 位、无符号 8 位、有符号 16 位、无符号 16 位、有符号 32
位、无符号 32 位、浮点 32 位、浮点 64 位

尼夫提 NIFTI-1 3D 图像 IO

可识别的文件扩展名:.NII、.nii

支持的元素类型:
有符号 8 位、无符号 8 位、有符号 16 位、无符号 16 位、有符号 32
位,无符号 32 位,有符号 64 位,无符号 64 位,浮点 32
位,浮点 64 位

声波 VFF 太阳光栅格式

可识别的文件扩展名:.VFF、.vff

支持的元素类型:
无符号 8 位,有符号 16 位

远景 3D视图

可识别的文件扩展名:.V、.VISTA、.v、.vista

支持的元素类型:
二进制数据,有符号 8 位,无符号 8 位,有符号 16 位,无符号 16 位,
有符号 32 位、无符号 32 位、浮点 32 位、浮点 64


vti 3D 图像 VTK-XML 输入和输出(实验性)。

可识别的文件扩展名:.VTI、.vti

支持的元素类型:
有符号 8 位、无符号 8 位、有符号 16 位、无符号 16 位、有符号 32
位、无符号 32 位、浮点 32 位、浮点 64 位

虚拟机 3D VTK 图像传统输入和输出(实验性)。

可识别的文件扩展名:.VTK、.VTKIMAGE、.vtk、.vtkimage

支持的元素类型:
二进制数据,有符号 8 位,无符号 8 位,有符号 16 位,无符号 16 位,
有符号 32 位、无符号 32 位、浮点 32 位、浮点 64


插件: 3d图像/形状


18n 18n 邻域 3D 形状创建器

(无参数)

26n 26n 邻域 3D 形状创建器

(无参数)

6n 6n 邻域 3D 形状创建器

(无参数)

包含给定半径内的像素的封闭球形邻域
r.,支持的参数有:

r = 2; 浮在 (0, inf)
球体半径。

插件: 3d变换/io


BBS 3D 转换的二进制(不可移植)序列化 IO

可识别的文件扩展名:.bbs

数据池 与内部数据池之间的虚拟 IO

可识别的文件扩展名:.@

远景 3D 转换的 Vista 存储

可识别的文件扩展名:.v、.v3dt

XML 3D 转换的 XML 序列化 IO

可识别的文件扩展名:.x3dt


评估边界填充为 5 的边界框(由二值化产生的掩码)
最小值为 10.10,图像 image.v 中的边界填充为 5。

mia-3dpropose-boundingbox -i image.v -f binarize:min=10 -p 5

作者


格特·沃尔尼

版权


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绝对没有保证,您可以根据 GNU 的条款重新分发它
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选项“--版权”。

使用 onworks.net 服务在线使用 mia-3dpropose-boundingbox


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