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micalc - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 micalc

这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一(例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器)在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 micalc

程序:

名称


micalc - 使用数据集执行基本数学运算

商品描述


micalc:使用数据集进行基础数学运算

文件格式由其文件扩展名自动识别。 对于二进制
对两个输入文件的操作,将使用第一个输入文件的协议
用于输出文件。

微克 能够 be 用过的 in 一种 of 练习 以下 模式:
数据集和/或标量的二元运算:

micalc [-if1 | -in1 ] -操作
[-if2 | -in2
] -的

一组数据的累加:

微克 -如果 -操作

一个数据的变换(幅度、对数、否定、反演或acos)
组:

微克 -如果 -操作 -的

一组数据的统计:

微克 -如果 [-意思] [-标准开发] [-fluct
] [-t课程][-历史
-histlots [-组蛋白] [-histmax ]
[-rightstairs] [-histfract] [-loghist] ]

额外服务 opţiuni:
-面具

文件 opţiuni:
-日期:扫描日期 [yyyymmdd](默认值 = 20140807yyyymmdd)

-fp: FOV 在相位方向 [mm] (默认 = 220.0mm)

-fr: 读取方向的 FOV [mm] (默认 = 220.0mm)

-fs:切片方向的 FOV [mm](默认值 = 5.0mm)

-nr:连续测量的次数(默认值=1)

-nx:读取方向的点数(默认值=128)

-ny:相位方向上的点数(默认值=128)

-nz:切片方向的点数(默认值=1)

-出生:患者的出生日期 [yyyymmdd](默认值 = 00000000yyyymmdd)

-pid:唯一的患者标识符(默认值=未知)

-pname:患者全名(默认=未知)

-psex:患者性别(选项=MFO,默认=O)

-pweight:患者体重 [kg](默认值 = 50.0kg)

-科学的:科学家姓名(默认=未知)

-sd:切片间距(从中心到中心)[mm](默认=10.0mm)

-serd:系列描述(默认=未知)

-塞尔诺:系列号(默认= 1)

-st: 切片厚度 [mm] (默认=5.0mm)

-螺柱:研究描述(默认=未知)

-tcname:发射线圈的名称(默认=未知)

-茶: 序列的回波时间 [ms] (默认 = 80.0ms)

-时间: 扫描时间 [hhmmss] (默认=091012hhmmss)

-tr:连续激励之间的时间 [ms](默认值 = 1000.0ms)

-cplx: 将数据视为复杂的并提取给定的组件 (options=none abs pha real
图像,默认=无)

-ds: 如果读取多个数据集,则要提取的数据集索引

-过滤: 只读那些协议参数“key”包含字符串的数据集
“值”(以“键=值”格式给出)

-fmap:为了减少内存使用,在读取(原始)数据后保持文件映射,但写入
进入数组会导致崩溃

-jdx: 如果存在多个 JDX 阵列,请选择此项

-方言: 使用给定的格式方言读取数据。 (默认为无方言)

-射频: 读取格式,用它来覆盖文件扩展名(选项=自动检测 3db 分析 asc
coi dat dcm 双浮点 gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit ,默认=自动检测)

-跳过: 在读取原始数据之前跳过这个字节数(默认值=0)

文件 opţiuni:
-附加: 附加到现有文件,仅适用于原始数据

-fnamepar: 以空格分隔的协议参数列表,在创建唯一的时包含
文件名

-noscale: 存储整数时不要重新调整值

-分裂:强制将协议数据对拆分为单独的文件。

-类型: 图像表示类型 (options=automatic float double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit ,默认=自动)

-w方言: 使用给定的格式方言写入数据。 (默认为无方言)

-wf: 写入格式,用它来覆盖文件扩展名(选项=自动检测 3db 分析 asc
coi dat dcm 双浮点 gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit ,默认=自动检测)

-wp: 将协议单独存储到此文件中。

过滤器 应用的 输入 文件(S) 面具:
-对齐 :将数据与几何(体素位置)对齐
外部文件

-自动掩码 :使用基于直方图的自动阈值创建掩码

-簇 :创建非零相邻/下一个相邻体素的集群,按大小排序

-卷积 <convolution kernel (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ),核直径 [mm]> : 空间维度的卷积

-去趋势 <Number of low frequency components to be removed,Zero mean of resulting
timecourse> :随着时间的推移消除缓慢漂移

-编辑 <Position/range string in the format (timeframe,slicepos,phasepos,readpos),new value
of voxel> : 编辑单个体素值

-genmask :创建包含所有具有值的体素的蒙版
在给定范围内

-各向同性 :通过插值使图像体素各向同性(图像
几何形状不会改变)

-低通 : 低通滤波

-最大限度 : 裁剪所有高于最大值的值

-maxip : 执行最大强度投影
给定方向

-合并 : 通过扩展时间维度将数据集合并为单个数据集

-分钟 : 剪裁低于最小值的所有值

-minip : 执行最小强度投影
给定方向

-noNaN : 用给定的值替换每个 NaN

-pflip : 在相位方向翻转数据

-prange : 选择范围
相位方向

-项目 : 对给定的进行平均投影
方向

-分位数掩码 :创建包含给定分数上方的所有体素的蒙版
门槛

-重新采样 : 图像数据的时间调整

-调整大小 : 图像数据的空间调整

-重新切片 : 将图像重新切片为给定的
取向

-rflip : 在读取方向翻转数据

-腐烂 : 平面内旋转

-排列 : 选择范围
阅读方向

-规模 :重新调整图像值

- 翻转 : 在切片方向翻转数据

-转移 <readDirection shift [pixel],phaseDirection shift [pixel],sliceDirection shift
[pixel]> : 在空间上移动数据

-切片时间 : 更正
不同切片采集时间点

-拼接 : 拼接
给定方向的图像

-范围 : 选择范围
切片方向

-swapdim <[rps][-],[rps][-],[rps][-]> : 通过指定方向交换/反射尺寸
三重附加可选反射标志

-瓦 : 将切片组合成一个方形的二维图像

-奇怪的 : 选择范围
时间方向

-tshift : 及时移动数据

-typemax : 剪辑高于特定数据类型最大值的所有值

-typemin : 剪裁低于特定数据类型最小值的所有值

-使用掩码 :创建一维数据集,包括来自文件的掩码内的所有值

其他 opţiuni:
-v 或者用于调试/跟踪所有组件或单个
组件,分别。 日志级别的可能值为:0(noLog)、1(errorLog)、
2(警告日志),3(信息日志)。

-h, - 帮帮我, -救命, - 版 : 打印帮助文本或版本信息

支持 文件 扩展(格式):
3db(Iris3D 二进制数据)

分析
(NIFTI/ANALYZE,方言:fsl)

asc(ASCII,方言:tcourse)

coi(JCAMP-DX 数据集)

dat (Matlab ascii 2D 数据矩阵)

dcm(DICOM,方言:西门子)

double(双重原始数据)

浮动(浮动原始数据)

gz(其他格式的 GNU-Zip 容器)

hdr(文件间,方言:neurostat)

hdr(NIFTI/ANALYZE,方言:fsl)

idx(ASCII 中非零的 3D 索引)

ima(DICOM,方言:西门子)

文件间
(文件间,方言:neurost)

jdx(JCAMP-DX 图像格式)

mag(DICOM,方言:西门子)

mhd(元图像)

nii (NIFTI/ANALYZE, 方言: fsl )

ph(DICOM,方言:西门子)

png(便携式网络图形)

pos(ASCII 中非零的 xy 位置)

pro(ODIN 测量协议)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit(有符号的 16 位原始数据)

s32bit(有符号的 32 位原始数据)

s8bit(有符号的 8 位原始数据)

smp(JCAMP-DX 数据集)

u16bit(无符号 16 位原始数据)

u32bit(无符号 32 位原始数据)

u8bit(无符号 8 位原始数据)

使用 onworks.net 服务在线使用 micalc


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