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肌肉 - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行肌肉

这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令肌肉,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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肌肉 - 多蛋白序列比对

概要


肌肉 -在 输入 文件 (快) [退房手续 产量 文件 (默认 快)[-诊断[-日志 日志 文件]
[-麦克西特斯 n[-最大小时数 n[-maxmb m[-html[-MSF[-clw[-限制]
[-日志[a] 日志文件[-安静的[-稳定的[-组[-版]

商品描述


本手册页简要记录了 肌肉 命令。

肌肉 比对蛋白质序列,被认为比 Clustal W 更好更快。

配置


-在 输入 文件
FASTA 格式输入文件的路径

退房手续 产量 文件
输出文件的路径,默认为 FASTA 格式

-诊断
查找对角线(对于相似序列更快)

-麦克西特斯 n
最大迭代次数(整数,默认 16)

-最大小时数 n
迭代的最长时间(以小时为单位)(默认无限制)

-maxmb m
以 Mb 为单位分配的最大内存(默认为 RAM 的 80%)

-html
以 HTML 格式写入输出(默认为 FASTA)

-MSF
以 MSF 格式写入输出(默认为 FASTA)

-clw
以 Clustal W 格式写入输出(默认为 FASTA)

-限制
作为 -clw,带有“CLUSTAL W (1.81)”标头

-日志[a] 日志文件
记录到文件(如果 -loga 则追加,如果 -log 则覆盖)

-安静的
不要将进度消息写入 stderr

-稳定的
按输入顺序输出序列(默认为 -group)

-组
按相似性对序列进行分组(这是默认设置)

-版
显示版本信息并退出

使用 onworks.net 服务在线使用肌肉


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