这是 patmatdbe 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
patmatdb - 搜索具有序列基序的蛋白质序列
概要
数据库 -序列 后继 -主题 绳子 -输出文件 报告
数据库 -救命
商品描述
数据库 是来自 EMBOSS(“欧洲分子生物学公开赛”)的命令行程序
软件套件”)。 它是“Protein:Motifs”命令组的一部分。
配置
输入 部分
-序列 后继
其他要求 部分
-主题 绳子
patmatdb 的模式基于 PROSITE 数据库中使用的模式格式。
例如:'[DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C' 是指以任意顺序排列的两个 Asps 或 Glus
通过 His、Ser、Pro 以外的任何残基,然后是任何残基中的两个,然后是 Pro
然后是两到四个任何残基,然后是 Cys。 搜索是
大小写无关,所以“AAA”匹配“aaa”。
输出 部分
-输出文件 报告
使用 onworks.net 服务在线使用 patmatdbe