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pepwheele - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 pepwheele

这是命令 pepwheele,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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pepwheel - 为蛋白质序列绘制螺旋轮图

概要


风速轮 -序列 序列 -轮 布尔 [-脚步 整数[-转 整数] -图形 图形
-两亲性 切换 -正方形 绳子 -钻石 绳子 -八角星 绳子

风速轮 -救命

商品描述


风速轮 是来自 EMBOSS(“欧洲分子生物学公开赛”)的命令行程序
软件套件”)。 它是“Display,Protein:2D Structure”命令组的一部分。

配置


输入 部分
-序列 序列

输出 部分
-轮 布尔
默认值:是

-脚步 整数
每转绘制的残基数是该值除以“转数”值。
默认值:18

-转 整数
每回合绘制的残基数是“步数”值除以该值。
默认值:5

-图形 图形

标记 部分
-两亲性 切换
如果这是真的,那么残差 ACFGILMVWY 被标记为正方形和所有其他
残留物未标记。 这会覆盖您可能已指定的任何其他标记
使用限定符“-squares”、“-diamonds”和“-octags”。

-正方形 绳子
默认情况下,脂肪族残基 ILVM 用正方形标记。 默认值:ILVM

-钻石 绳子
默认情况下,残基 DENQST 用菱形标记。 默认值:DENQST

-八角星 绳子
默认情况下,带正电的残基 HKR 用八角形标记。 默认
价值:HKR

使用 onworks.net 服务在线使用 pepwheele


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