这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 probcons，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
probcons - 对齐多个蛋白质序列并打印到标准输出
概要
问题 [OPTION[文件[文件]
商品描述
问题 是一种用于生成蛋白质序列多重比对的工具。 用一个
概率建模和基于一致性的对齐技术的结合，PROBCONS
已达到迄今为止所有对齐方法的最高准确度。 在 BAliBASE 上
基准比对数据库，PROBCONS 产生的比对统计显示
对当前程序的显着改进，正确率平均提高 7%
对齐的列比 T-Coffee 的列，比 T-Coffee 的列正确对齐的列高 11%
CLUSTAL W，并且比 DIALIGN 的列正确对齐的列多 14%。
问题 比对以 MFA 格式提供的序列。 这种格式由多个
序列。 MFA 格式中的每个序列都以单行描述开头，后跟
行序列数据。 描述行与序列数据的区别在于
第一列中的大于（“>”）符号。
配置
-clustalw
使用 CLUSTALW 输出格式而不是 MFA
-c - 一致性 每股收益
使用 0 <= 每股收益 <= 5（默认值：2）一致性转换的传递
-ir --迭代细化 每股收益
使用 0 <= 每股收益 <=1000（默认值：100）次迭代细化
-预 --预训练 每股收益
使用 0 <= 每股收益 <= 20（默认值：0）轮预训练
-对
生成所有对成对比对
-维特比
使用 Viterbi 算法生成所有对（自动启用 -对)
-v --详细
对齐时报告进度（默认：关闭）
-注释 文件名
为多重对齐写注释 文件名
-t - 火车 文件名
计算 EM 转移概率，存储在 文件名 （默认：无训练）
-e --排放量
还重新估计排放概率（默认值：关闭）
-p --参数文件 文件名
从中读取参数 文件名 （默认： ）
-a --对齐顺序
按对齐顺序而不是输入顺序打印序列（默认：关闭）
使用 onworks.net 服务在线使用 probcons
