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程序：
您的姓名
色带 - Raster3D 分子图形包色带抽屉
概要
“丝带” [-h[-d[0123456]] pdb文件
or
“丝带” [-h] -d[0123456] -（从标准输入中获取 PDB 记录）
彩色带 读取 PDB 坐标文件并在标准输出上生成一个包含 Raster3D 的文件
从三角形网格构造的带状表示的描述符记录。 这
文件由 色带 可以直接喂给 给予 或者它可以与
由其他 Raster3D 实用程序生成的描述符文件。
示例
将整个蛋白质链描述为从蓝色平滑着色的单个带
N 端在 C 端变为红色：
丝带-d2 protein.pdb | 渲染> chain_picture.png
要为每条链指定颜色的多链蛋白质着色：
cat chaincolors.pdb protein.pdb | 色带 -d5 - >chains.r3d
配置
-h
抑制输出中的标题记录。 默认情况下 色带 将产生一个输出文件
从包含一组默认缩放和处理选项的标题记录开始。
- -h 标志将抑制这些头记录，以便输出文件只包含
三角形描述符此选项对于生成仅描述部分的文件很有用
一个场景的，稍后将与其他生成的描述符文件组合
程式。
-d[0123456]
默认情况下 色带 需要交互式输入来选择色带参数和颜色
信息。 然而，实现了五种默认的配色方案，这些可能是
被选为命令行选项以绕过任何交互式输入。
-d 或 -d0 与下面的 -d2 相同
-d1 纯色色带（默认为蓝色）
-d2 从 N 端的蓝色到 C 端的红色
-d3 色带一面为蓝色，另一面为灰色
-d4 阴影前表面从蓝色到红色，后表面为灰色
-d5 使用连续色卡的颜色分离链
从输入流。 请注意，颜色记录上的模式匹配_未_完成；
当遇到新的链时，颜色会简单地按顺序获取。
-d6 根据取自 COLOR 的最近 CA 原子着色
记录在输入文件的头部
商品描述
输入到 色带 由包含颜色信息的单个文本文件组成
[可选] 和 PDB 数据库格式的原子坐标。 只有CA和羰基O原子
需要记录； 所有其他输入原子都被忽略。 色带参数和着色
程序运行时以交互方式指定。 键盘交互可能会被绕过
使用 -d 标志选择一种默认的配色方案。 三角形网格
功能区作为 Raster3D 描述符记录输出。 默认情况下，输出文件包含一个
组所需的头记录 给予 程序。 标题被构造为
包含与文件中包含的变换矩阵对应的 TMAT 矩阵
设置.matrix （如果存在），或文件中包含的欧拉角 安装角度 （如果
它存在）。
彩色带 产生蛋白质骨架的连续平滑痕迹。 对于更复杂的
蛋白质二级结构的表示最好使用不同的程序，
例如 MOLSCRIPT，而不是 色带.
环境
文件 setup.matrix 和 setup.angles（如果存在）会影响生成的头记录
by 色带.
源
匿名 FTP 现场：
ftp.bmsc.washington.edu网站
卷筒纸 网址：
http://www.bmsc.washington.edu/raster3d/raster3d.html
联系方式：
伊森·梅里特
华盛顿大学西雅图分校 WA 98195
[电子邮件保护]
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