这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 ring3d，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
rigns3d - 从 PDB 文件生成环形填充三角形文件
概要
ring3d [-bases] [-protein] [-sugars] < infile.pdb > outfile.r3d
戒指3d 搜索 PDB 文件，寻找包含 5 或 6 元的残基
环，然后生成环形填充三角形的 Raster3D 输出文件。
戒指3d 匹配残基和原子名称的内部列表中的残基类型。 它会
无法找到不在其列表中的残基，并且无法识别具有非标准的原子
名称。
示例
渲染一个带有碱基填充的 DNA 分子：
猫 $R3D_LIB/dna.colours dna.pdb | 棒 - 半径 0.05 > temp.1
ring3d -bases < dna.pdb > temp.2
cat temp.1 temp.2 | 渲染-tiff dna.tiff
配置
-碱基
填充来自 ACGTU 残基的嘌呤和嘧啶环。
-蛋白质
填充 HIS PHE TRP 和 TYR 残基的侧链环。
-糖
[这是默认值] 填充 GAL GLC NAG NGA MAN SIA 残基的吡喃糖环。
使用 onworks.net 服务在线使用 ring3d
