这是一个简单的命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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简单 - 明显的基于阵列的 kmer 计数器
概要
简单 [-f|-r|-C[-c 压片[-m 梅尔大小] -i 输入 -o 产量
商品描述
简单 是一个非常简单的 mer 计数器。 它分配了一个巨大的 32 位数组,填充
带有 mers 的数组,排序并写入输出。 它将为每个 kmer 分配 4 个字节。 k=16
将需要 16 GB 才能运行。
配置
-i 输入
-o 产量
-m 梅尔大小
梅尔大小。 默认值为 22
-f 转发 kmer(这是默认设置)
-r 反向公里
-C 规范的 kmer(字典序较小的正向和反向 kmer
地点)
-c # mer压缩
使用 onworks.net 服务使用简单的在线