这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 sirnae，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
sirna - 在 mRNA 中发现 siRNA 双链体
概要
锡尔纳 -序列 后继 [-poliiii 布尔[-aa 布尔[-tt 布尔[-多碱基 布尔]
-输出文件 报告 -outseq 后序器 [-语境 布尔]
锡尔纳 -救命
商品描述
锡尔纳 是来自 EMBOSS（“欧洲分子生物学开放软件
套房”）。 它是“Nucleic:Functional sites,Nucleic:2D structure”命令的一部分
组。
配置
输入 部分
-序列 后继
序列 输入 选项
-poliiii 布尔
此选项允许您仅选择以嘌呤开头的 21 个碱基探针和
所以可以从Pol III表达载体表达。 这是 纳恩(17)YNN模式
Tuschl 等人已经提出了这一建议。 默认值：N
-aa 布尔
此选项允许您仅选择以 AA 开头的那 23 个基本区域。 如果
未选择此选项，则以 AA 开头的区域将受到青睐
它们的分数更高，但也将报告不以 AA 开头的区域。
默认值：N
-tt 布尔
此选项允许您仅选择以 TT 结尾的那 23 个基本区域。 如果这
选项没有被选中，那么以 TT 结尾的区域将通过给他们一个
更高的分数，但不以 TT 结尾的区域也会被报告。 默认
值：N
-多碱基 布尔
如果此选项为 FALSE，则只有 23 个没有重复 4 或
将报告更多的连续碱基。 永远不会报告任何地区
连续有 4 个或更多 G。 默认值：是
输出 部分
-输出文件 报告
输出是 21 碱基 siRNA 双链体的正向和反向部分的表。
正向和反向序列均从 5' 到 3' 写入，准备订购。 这
最后两个碱基已被“dTdT”取代。 23基地的起始位置
区域和 %GC 含量也给出。 如果您想查看完整的 23 个碱基
序列，然后查看另一个输出文件中的序列，或使用
限定符 '-context' 将在此显示前向序列的 23 个碱基
报告中括号中的前两个碱基。 前两个碱基不构成
要订购的 siRNA 探针。
-outseq 后序器
这是选择siRNAs的23个碱基区域的序列文件
从。 您可以使用它来搜索 mRNA 数据库（例如 REFSEQ）以确认
探针对于您希望对其使用的基因是独一无二的。
-语境 布尔
输出报告文件给出了准备进行的 21 个碱基 siRNA 区域的序列
下令。 这不会为您提供 2 个碱基之前的 21 个碱基的指示。 它
查看哪些建议的可能探针区域具有“AA”通常很有趣
在它们前面（即查看 23 个基本区域中的哪个以
'AA'）。 此选项显示该区域的全部 23 个碱基以及前两个碱基
在括号中，例如 '(AA)' 为您提供探针区域的一些上下文。 你不应该
订购探头时，请在括号中包含两个底座。 默认
值：N
使用 onworks.net 服务在线使用 sirnae
