这是命令 soapdenovo2 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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soapdenovo2 - 可以构建从头草稿组装的短读组装方法
概要
肥皂德诺沃_63mer 肥皂德诺沃_127mer
介绍
SOAPdenovo 是一种新颖的短读组装方法，可以构建从头组装草图
对于人类大小的基因组。 该程序专门用于组装 Illumina GA
短读。 它为构建参考序列和携带
以具有成本效益的方式对未探索的基因组进行准确分析。
1) 支持高达 127 的大型 kmer 以利用长读取。 提供三个版本。
I. 31mer 版本仅支持 kmer <=31。
二、 63mer 版本只支持 kmer <=63 并且内存消耗比
31mer 版本，甚至与 kmer <=31 一起使用。
三、 127mer 版本只支持 kmer <=127 并且内存消耗比
63mer 版本，甚至与 kmer <=63 一起使用。
请注意，随着kmer的增加，节点数量会显着减少，
因此内存消耗通常小于移位版本的两倍。
有关更多信息，请查看 /usr/share/doc/soapdenovo2 或 soapdenovo 中的手册
网站。
使用 onworks.net 服务在线使用 soapdenovo2
