这是 TMscore 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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TM-score - 一种计算两种蛋白质拓扑相似度的算法
结构
VERSION
本文档参考 2011/01/30 发布的 TM-score 版本
概要
1. 运行 TM-score 来比较“model”和“native”：
TMscore 模型原生
2. 使用指定的 d0 运行 TM-score，例如 5 埃：
TMscore 模型本机 -d 5
3. 使用叠加输出运行 TM-score，例如 'TM.sup'，并在 Rasmol 中查看：
TMscore 模型本机 -o TM.sup
rasmol -脚本 TM.sup
商品描述
该程序是为了比较两种蛋白质结构并确定最佳叠加
拥有最高的 TM 分数。 输入结构必须采用 PDB 格式。 默认情况下，TM-score
被第二个蛋白质标准化。 用户可以通过简单的方式获得简要说明
不带参数运行程序。
配置
-o filename.sup 输出叠加到指定文件，
适用于 rasmol。
-d value 将 d0 设置为指定的埃数。
使用 onworks.net 服务在线使用 TMscore
