这是 vcf-fix-ploidy 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
vcf 修复倍体 - vcf 修复倍体
概要
猫 破.vcf | vcf-修复-倍性 [配置] > 固定.vcf
配置
-a, --假定性别
M 或 F,如果列表不完整,则需要 -s
-l, --修复可能性
添加或删除 het 可能性(不是默认行为)
-p, --倍性
倍性定义。 默认值如下所示。
-s, --样品
样本性别列表(sample_name [MF])。
-h, -?, - 帮帮我
此帮助信息。
默认 倍性 定义:
倍性 => {
X => [
# 假常染色体区域 60,001-2,699,520 和 154,931,044-155,270,560
倍性 2 { from=>1, to=>60_000, M=>1 }, { from=>2_699_521, to=>154_931_043, M=>1 },
], Y => [
# 女性没有chrY,男性有一份{ from=>1, to=>59_373_566, M=>1, F=>0 },
], MT => [
# 男性和女性的单倍体 MT { from=>1, to => 16_569, M=>1, F=>1 },
],
}
使用 onworks.net 服务在线使用 vcf-fix-ploidy