这是名为 Allelome.PRO 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 Allelome.PRO_original_NAR_2015.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Allelome.PRO 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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等位基因
商品描述
从高通量测序数据中检测等位基因偏差需要一种最大化
灵敏度,同时最大限度地减少误报。 在这里,我们展示了 Allelome.PRO,一个自动化的用户友好型
生物信息学管道,它使用来自互惠杂交的高通量测序数据
两种基因不同的小鼠品系,以检测等位基因特异性表达和染色质
修改。 Allelome.PRO 扩展了先前研究中使用的专门分析
印记表达通过自动对“等位基因”进行分类来给出“等位基因”的完整图片
给定细胞类型中所有基因的等位基因表达为印迹、菌株偏向的双等位基因或非信息性基因。
Allelome.PRO 提高了分析低表达转录本的灵敏度,一起
根据测序数据的变化凭经验计算出强大的错误发现率。
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
Unix Shell、Perl、S/R
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/allelomepro/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。