这是一个名为 Altrans 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可以下载为 altrans.v1.1.02.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 Altrans 的应用程序，可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
Altrans 将在 Linux 上在线运行
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商品描述
Altrans 是一种拼接事件相对量化的方法。 它需要来自 RNA-seq 实验的 BAM 比对文件和 GTF 格式的注释文件，详细说明外显子在基因组中的位置。 它使用配对末端读取，其中一个配偶映射到一个外显子，另一个配偶映射到不同的外显子和/或跨越外显子外显子连接的拆分读取来计算两个外显子之间的“链接”。 当存在重叠外显子时，它们被分组到“外显子组”中，并确定外显子组中每个外显子的独特部分，用于将读数分配给外显子。 给定插入尺寸分布（称为链路覆盖范围），从独特区域确定的链路计数用观察到这种链路的概率归一化。 最后，产生的定量度量是一个链接的覆盖率与初始第一个外显子产生的所有链接的覆盖率总和的分数。目的
学术/科研
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/altrans/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
