这是名为 AmPEP 和 AxPEP 的 Linux 应用程序，其最新版本可作为 deep-ampep30-test_set.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 AmPEP 和 AxPEP 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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AmPEP 和 AxPEP
商品描述
由于其广泛的活性和低毒性，抗微生物肽 (AMP) 是对抗多药耐药病原体的有希望的候选者。 然而，通过湿实验室实验鉴定 AMP 仍然昂贵且耗时。 AmPEP 是一种使用随机森林算法进行 AMP 预测的准确计算方法。 预测模型基于氨基酸特性沿序列的分布模式。 我们的最佳模型 AmPEP 具有 1:3 的数据比，实现了 96% 的非常高的准确度，MCC 为 0.9，AUC-ROC 为 0.99，Kappa 统计量为 0.9。 当使用基准数据集进行测试时，AmPEP 在准确性、MCC 和 AUC-ROC 方面优于现有方法。功能
- MATLAB源代码
- AmPEP 数据集
- 机器识别
- 生物信息学
- 肽序列
- 药物发现
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/axpep/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
