这是名为 BiomeNet 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可作为 BiomeNet.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 BiomeNet 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
BiomeNet 在 Linux 上在线运行
Ad
商品描述
宏基因组学产生了大量可以分配代谢功能的微生物序列。 由于缺乏合适的统计框架,使用这些数据来推断社区水平的代谢差异受到阻碍。 在这里,我们描述了一种新的分层贝叶斯模型,称为 BiomeNet(代谢网络的贝叶斯推理),用于推断微生物群落之间代谢网络的差异流行。 为了推断社区级代谢相互作用的结构,BiomeNet 将混合成员建模框架应用于酶丰度信息。 基本思想是模型的混合成分(代谢反应、子网络和网络)在所有组(微生物组样本)之间共享,但混合比例因组而异。 通过这个框架,模型可以捕获数据中的嵌套结构。 BiomeNet 在将每个宏基因组样本建模为复杂代谢系统(代谢系统)的混合物方面是独一无二的。目的
学术/科研
程式语言
C++,S/R
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/biomenet/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。