这是名为 BLAST Ring Image Generator 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 BRIG-0.95-dist.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 BLAST Ring Image Generator 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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BLAST 环形图像生成器
商品描述
BRIG 是一个跨平台（Windows/Mac/Unix）应用程序，可以显示大量基因组之间的循环比较，重点是处理基因组组装数据。如果 BRIG 用于生成出版物数字，请引用 BRIG 论文：NF Alikhan、NK Petty、NL Ben Zakour、SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG)：简单原核生物基因组比较，BMC Genomics，12:402。 PMID：21824423
特性
- 图像将中心参考序列与其他序列之间的相似性显示为同心环。
- BRIG 将通过简单的 GUI 自动执行所有 BLAST 比较和文件解析。
- 可以显示基因组草图的重叠群边界和读取覆盖率； 可以显示定制的图形和注释。
- 使用用户定义的一组基因作为输入，BRIG 可以显示一组完整基因组、基因组草图甚至未组装的原始序列数据中的基因存在、缺失、截断或序列变异。
- BRIG 还接受 SAM 格式的读取映射文件，从而可以同时比较来自多个样本的未组装序列数据中存在的基因组区域
目的
学术/科研
程式语言
爪哇岛
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/brig/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
