这是名为 CAMPARI 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可作为 campari_v3_09052017.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 CAMPAR 的应用程序,可免费在 Linux 上运行 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
CAMPRI 在 Linux 上在线运行
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商品描述
我们很自豪地推出 CAMPRI 的第 3 版。 与版本 2 相比,这是一个很大的进步,主要是由于全面的 OpenMP(线程并行)支持以及可用性和性能的显着改进。 我们还从最近的文献中再次添加了一些新算法,当然,CAMPARI 继续支持 ABSINTH 力场范式和隐式求解模型。CAMPARI 是一个联合软件包,用于执行和分析分子模拟,特别是与生物相关的聚合物。 它侧重于(高级)采样算法的广泛可用性,并且能够以无缝方式结合蒙特卡罗和分子动力学采样。 CAMPRI 为用户提供了对所有已实现功能的高度控制。 有关更多信息和功能,请参阅项目主页: http://campari.sourceforge.net. 版本 2 不再积极维护,但最终版本继续可用。
特性
- 组合 MC 和 MD 采样,笛卡尔或扭转/刚体空间中的 MD
- 所有核心能量/力例程的高效 OpenMP 并行化
- 作为轨迹分析工具的动态分析或执行(也并行)
- 许多内置分析程序(DSSP、接触图、配对相关函数等)
- 支持多种结构聚类和相关算法以及马尔可夫状态模型分析
- 完整记录 (html) 并附带 13 个教程
- 非常高水平的控制(例如,MD 中的自定义完整约束)
- 广泛支持并行多副本模拟技术,例如混合 MPI/OpenMP 并行执行中的副本交换
- 用于聚类/马尔可夫状态模型工具的独立分析工具
目的
学术/科研
用户界面
控制台/终端
程式语言
Fortran语言
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/campari/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。