这是一个名为 Covidex 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 Covidex_2021_11_27.rar。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Covidex 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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冠状病毒
商品描述
病毒亚型或进化枝代表来自特定物种全球种群的分离株之间的集群。 亚型化与病毒流行病学、进化和发病机制的研究相关。 从这个意义上说，Covidex 被开发为一种开源的无对齐机器学习子类型工具。 它是一款闪亮的应用程序，可以快速准确地对预定义集群中的病毒基因组进行分类。 如果加载的序列超过 1000 个，该工具将以多线程模式运行。 能够在不到一分钟的时间内对 16000 个基因组序列进行分类（AMD Ryzen 7 1700 8 核处理器 3 GHz）
对于基于 Web 的应用程序版本（仅适用于小数据集：最大 100 seqs），请访问
http://covidex.unlu.edu.ar
如果您使用 Covidex，请考虑引用以下预印本：
https://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.08.21.261347v1
如果你觉得我的作品有用，可以请我喝杯咖啡！ https://www.buymeacoffee.com/mcacciabue
功能
- 序列的子类型化
- 用户友好的界面
- 汇总图
- Windows 便携版（无需安装）
- 多线程模式
目的
科学/研究，最终用户/桌面
程式语言
R
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/covidex/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
