这是一个名为 FamSeq 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可以下载为 FamSeq1.0.2.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 FamSeq 的应用程序，可免费在 Linux 上运行 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
FamSeq 在 Linux 上在线运行
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商品描述
调用稀有变体仍然具有挑战性。 在基于家族的测序研究中，应该利用来自所有家族成员的信息来更准确地识别新的种系突变。 FamSeq 通过提供给定他/她整个家庭的原始测量值的个人携带变异的概率来实现这一目的。 FamSeq 可容纳 de novo 突变，并可在染色体 X 上执行变异调用。为了适应数据复杂性的变化，FamSeq 包含三种不同的孟德尔遗传模型实现：贝叶斯网络算法、Elston-Stewart 算法和马尔可夫链蒙特卡罗算法。 为了使该软件高效并适用于大家庭，我们并行处理了贝叶斯网络算法，该算法处理具有近亲繁殖循环的谱系，而不会损失 NVIDIA® 图形处理单元的计算精度。
目的
学术/科研
程式语言
C + +中
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/famseq/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
