这是名为 GeneMiner 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 GeneMiner_win64_20250709.zip。它可以在免费的工作站托管服务提供商 OnWorks 上在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行此名为 GeneMiner 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
基因挖掘
Ad
商品描述
GeneMiner2 基于我们之前开发的 GeneMiner 和 Easy353 软件，并集成了 Blast、Minimap2、Fasttree、Muscle5、Mafft、Astral、PPD、PGA、NOVOPlasty 和 OrthoFinder 等优秀工具。使用相应功能时，请参考软件提示的文献。
我们的 GeneMiner2 手稿目前正在审查中：
余晓燕，唐志忠，张哲，宋永祥，何华，石燕，侯建强，余颖。GeneMiner2：从基因组数据中精准自动恢复基因。已提交稿件，2025年。
在该论文正式发表之前，请引用我们早期的研究成果：
张哲, 谢培兰, 郭永玲, 周文斌, 刘英伟, 余勇. 2022. Easy353: 一种获取被子植物353个基因用于系统发育基因组学研究的工具. 分子生物学与进化 39(12): msac261。
谢鹏飞, 郭燕玲, 滕毅, 周文斌, 余勇. 2024. GeneMiner：从新一代测序数据中提取系统发育标记的工具. 分子生态资源 e139.
功能
- 目标基因组装
- 系统发育重建
此应用程序也可从 https://sourceforge.net/projects/geneminer/ 获取。它已托管在 OnWorks 中，以便通过我们的免费操作系统以最便捷的方式在线运行。
