这是名为 HMCan 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 HMCan.tar.gz 下载。它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并使用 OnWorks 在线运行名为 HMCan 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
HMCan
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商品描述
HMCan 是基于隐马尔可夫模型的工具,开发用于检测癌症 ChIP-seq 数据中的组蛋白修饰。 它对数据应用三个校正步骤:拷贝数校正、GC 偏差校正和噪声水平校正。
为了运行 HMCan,需要 ChIP-seq 目标对齐文件和控制对齐文件。 还需要一些配置,有关更多信息,请查看 README 文件。
添加一名作者
联系人:Valentina Boeva Institute Curie
Haitham Ashoor King Abdullah 科技大学。
程式语言
C + +中
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/hmcan/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。