这是名为 iMSAT 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以作为 SSRs.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 iMSAT 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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iMSAT 在 Linux 上在线运行
商品描述
iMSAT 代表了 vcf2MSAT 程序的完整更新。 该命令行 Python 程序允许用户使用使用 SAM 和 BAM 工具生成的多态性数据以及 .fasta 对齐文件来搜索多态性微卫星标记(MSAT 或 STR)。 通过识别多态制造商,而不是像以前的程序所做的简单重复区域,iMSAT 大大提高了可识别多态 MSAT 的速度——为研究人员节省了宝贵的时间和金钱。 访问 http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract 对于描述 iMSAT 效用的 pdf 文章,如果您使用该程序,请引用本文为:Andersen 和 Mills:iMSAT:一种使用条形码 Illumina 文库开发微卫星位点的新方法。 BMC 基因组学 2014 年 15:858。特征
- 多态微卫星识别
- Illumina测序
- 基因组分析
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
蟒蛇
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/imsat/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。