这是名为 KMC-KaiC 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 KMC_KaiC_Original.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 KMC-KaiC 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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KMC-凯奇
商品描述
此代码是专用的动力学蒙特卡罗 (KMC) 算法，它模拟翻译后 Kai 生物钟的模型。
该代码允许您在单个 KaiC 六聚体和单体水平上模拟 Kai 系统，并明确跟踪每个 ATP 核苷酸的周转。 除了 ATP 水解外，所有反应都遵循详细的平衡。
该代码的应用在我们题为“翻译后 Kai 生物钟的热力学一致模型”的文章中进行了描述，该文章可在开放获取期刊 PLOS Computational Biology 上免费获得：
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005415
*更新* 我们制作了我们模型的完全可逆版本，包括 ATP 水解的逆反应。 这使得在热力学平衡下运行模型成为可能。 此版本的模型可以在 KMC_KaiC_Rev.zip 下下载。
如果您想将我们的模型用于自己的研究，请引用我们的 PLoS 计算生物学论文。
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
C + +中
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/kmc-kaic/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
