这是名为 MAF 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 MAF.zip。它可以在免费的工作站托管服务提供商 OnWorks 上在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行此名为 MAF 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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MAF
商品描述
DNA 和 RNA 核苷酸序列是所有生物细胞中普遍存在的元素,它们一方面是细胞的综合功能库,另一方面也是控制细胞功能的强大调控系统。本文提出的多重比对框架 (MAF) 应为研究人员提供一个简单的序列比对平台,可作为功能模板。该平台不仅足够灵活,可以调整所有步骤,而且功能全面,能够在需要深入分析或在低读取率等情况下建议使用时,整合多种不同的工具和自定义参数组合。该平台使研究人员能够灵活组合使用多个序列比对工具以及其他预处理和后处理工具,以分析应用于同一数据基础的不同序列比对和处理算法之间从细微到显著的差异。
引用以下出版物: https://doi.org/10.3390/mps8030065
功能
- 以 Bash 脚本为例,联合使用不同的对齐工具
- 灵活的预处理和后处理步骤,可扩展且完全可重新设计
- 节省开发时间的 Bash 模板
分类
此应用程序也可从 https://sourceforge.net/projects/multialignmentframework/ 获取。它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统之一以最便捷的方式在线运行。