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MCPerm:适用于 Linux 的 Monte Carlo SNP 置换下载

免费下载 MCPerm:Monte Carlo SNP 置换 Linux 应用程序,可在 Ubuntu online、Fedora online 或 Debian online 中在线运行

这是名为 MCPerm: Monte Carlo SNP permutation 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 MCPerm_1.1.2.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

免费下载并在线运行这个名为 MCPerm: Monte Carlo SNP permutation with OnWorks 的应用程序。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

MCPerm:蒙特卡洛 SNP 置换


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商品描述

MCPerm:病例对照关联研究中多重检验相关性的蒙特卡罗排列方法
传统置换(TradPerm)检验是一种重要的非参数分析方法,可作为病例对照关联研究中多重检验校正的金标准。 然而,它依赖于原始的单核苷酸多态性(SNP)基因型和表型数据来执行大量随机洗牌,因此计算量大,特别是对于全基因组关联研究(GWAS)。 为了在不改变 TradPerm p 值大小的情况下提高计算速度,我们开发了一种蒙特卡罗排列 (MCPerm) 方法作为 TradPerm 的有效替代方法。
方法:MCPerm 不需要打乱原始基因型和表型数据。 它使用蒙特卡罗方法,采用两步超几何分布来生成病例和对照中基因型(AA、Aa 和 aa)的随机数。



程式语言

S / R


分类

生物信息学、统计学

这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/mcperm/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。


免费服务器和工作站

下载 Windows 和 Linux 应用程序

Linux 命令

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