这是名为 MCPerm: Monte Carlo SNP permutation 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 MCPerm_1.1.2.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 MCPerm: Monte Carlo SNP permutation with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
MCPerm：蒙特卡洛 SNP 置换
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商品描述
MCPerm：病例对照关联研究中多重检验相关性的蒙特卡罗排列方法
传统置换（TradPerm）检验是一种重要的非参数分析方法，可作为病例对照关联研究中多重检验校正的金标准。 然而，它依赖于原始的单核苷酸多态性（SNP）基因型和表型数据来执行大量随机洗牌，因此计算量大，特别是对于全基因组关联研究（GWAS）。 为了在不改变 TradPerm p 值大小的情况下提高计算速度，我们开发了一种蒙特卡罗排列 (MCPerm) 方法作为 TradPerm 的有效替代方法。
方法：MCPerm 不需要打乱原始基因型和表型数据。 它使用蒙特卡罗方法，采用两步超几何分布来生成病例和对照中基因型（AA、Aa 和 aa）的随机数。
程式语言
S / R
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/mcperm/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
