这是一个名为 MGEScan 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可以下载为 MGEScan1.3.1.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 MGEScan 的应用程序，可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
MGEScan 在 Linux 上在线运行
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商品描述
MGEScan 是一套包含两个软件工具 MGEScan-LTR 和 MGEScan-non-LTR 的套件。MGEScan-LTR 是一款无需依赖已知元素库即可识别新的 LTR 逆转录转座子的软件。 它使用近似字符串匹配技术和蛋白质域分析来检测完整的 LTR 逆转录转座子。 此外，它还使用配置文件隐马尔可夫模型 (pHMM) 识别部分删除或单独的 LTR。
MGEScan-non-LTR 是一种用于识别基因组序列中非 LTR 逆转录转座子的软件，其计算方法受广义隐马尔可夫模型 (GHMM) 启发。
参考文献：
1. M. Rho 等人，“真核基因组中 LTR 逆转录转座子的从头鉴定”，BMC Genomics (2007) 8:90。
2. M. Rho 和 H. Tang，“MGEScan-non-LTR：真核基因组中自主非 LTR 逆转录转座子的计算识别和分类”，核酸研究 (2009) 37:21。
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
语言，C++
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/mgescan/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
