这是名为 MITP 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 MITP-1.1.tar.gz 下载。它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行名为 MITP 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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麻省理工学院
商品描述
miRNA 是一种广为人知的非编码小 RNA，可介导植物和动物最重要生物过程的基因调控。 因此，在模型和新测序物种中鉴定保守和新的miRNA及其靶基因是不可避免的。 MITP 旨在根据来自任何映射软件的序列映射结果轻松快速地识别 miRNA，这些映射软件产生 SAM 格式输出结果、blast 结果（默认输出结果）或 blat 结果（默认输出结果）。 该程序提供了一个步骤参数（8 个步骤），可以允许从任何步骤运行程序并完成所有剩余的步骤。 您还可以使用每个步骤程序逐步运行。 请在运行主程序MITP.pl 的同一目录中运行这些步骤程序。 一些步骤是可选的（读取过滤器、表达、miRNA 类别和目标）。 当您选择属于这些可选步骤的相关参数时，程序将运行这些步骤。 否则，它跳过这些步骤。
功能
- 根据已知miRNA与基因组序列的BLAST结果识别保守miRNA
- 根据默认 BLAST 输出、BLAT 输出或 SAM 格式文件中的比对结果识别新的 miRNA
- 识别小 RNA 区域
- 预测miRNA靶基因
- 比较不同物种的miRNA
目的
学术/科研
程式语言
Perl的
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/mitp/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
