这是名为 PB-sQF_BacterialTyping 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 PBsQF_Mac.zip 下载。 它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行名为 PB-sQF_BacterialTyping 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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PB-sQF_细菌分型
商品描述
概率分箱 - 签名二次形式，PB-sQF，将未知序列键入 628 个细菌文库基因组之一，该序列给出最小的测试统计数据，从而提供最相似的文库菌株。
输入文件是由 P. Audano 等人开发的 KAnalyze 生成的未知组装基因组序列的 k-mer 计数或十进制格式的原始短读文件。 （https://sourceforge.net/projects/kanalyze/).
下载内容包括库索引、库名称和样本未知数。
特性
- 计算文库和未知 k-mer 频率之间的测试统计数据
- 细菌序列分型
- Windows
- Mac
程式语言
MATLAB
分类
该应用程序也可以从 https://sourceforge.net/projects/pb-sqf-bacterialtyping/ 获取。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
