这是一个名为 PyBrella 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以作为 pybrella.py 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 PyBrella 的应用程序,可免费在 Linux 上运行 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
PyBrella 在 Linux 上在线运行
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商品描述
PyBrella 是一个脚本,旨在使用 AMBER 分子动力学包自动化伞状采样过程。特征
- 使用用户定义的起点和终点,自动设置和执行 MD 运行以对距离参数进行伞形采样。
- 根据 80/20 卡方距离方法执行样本收敛的确认。
- 检查样本直方图并在必要时自动开始新样本以达到指定的采样阈值。
目的
学术/科研
程式语言
蟒蛇
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/pybrella/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。