这是名为 QUASR 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 QUASR_v6.08.tar 下载。它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行名为 QUASR 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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夸斯罗
商品描述
QUASR 是一个轻量级管道,用于处理和分析来自 Illumina、454 和 Ion Torrent 平台的下一代测序 (NGS) 数据。 尽管最初是为病毒数据编写的,但它的通用性足以处理任何 NGS 数据集。 功能包括:
重复删除
解复用
去除底漆
质量保证 (QA) 绘图
质量控制 (QC)
共识生成
少数变量决定
少数变量图
当前的主要版本是 6.X,它是用 Python3 编写的。 7.X 是我用 Java 重写的,但仍在进行中。 两者都被编写为尽可能轻量级,因此它们可以在台式机或笔记本电脑以及计算集群上以最少的内存要求运行。
如果您对 QUASR 有任何问题,请通过自述文件中提供的电子邮件地址与我联系。
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
蟒蛇
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/quasr/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。