这是名为 SUPERmerge 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以作为 SUPERmerge.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 SUPERmerge 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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SUPERmerge 在 Linux 上在线运行
商品描述
SUPERmerge 是一种 ChIP-seq 读取堆积分析和注释算法,用于在单个碱基对分辨率级别研究具有广泛染色质域的弥散组蛋白修饰 ChIP-seq 数据集的对齐 (BAM) 文件。 SUPERmerge 允许灵活调节各种读取堆积参数,从而揭示读取岛如何聚合成整个基因组的覆盖区域,以及它们在单个生物复制中映射到哪些注释特征。 SUPERmerge 对于研究小样本量的 ChIP-seq 实验特别有用,在这些实验中,表观遗传组蛋白修饰(例如,H3K9me1、H3K27me3)会产生固有的宽峰,信号富集的扩散范围跨越多个连续的基因组位点和注释特征。特性
- 芯片序列
- 表观遗传学
- 生物信息学
- 计算生物学
目的
学术/科研
程式语言
C
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/supermerge/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。