这是 Intel Xeon Phi 上名为 SWAPHI: Smith-Waterman 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 swaphi-v1.0.5.tar.gz 下载。它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在 Intel Xeon Phi 上使用 OnWorks 在线运行名为 SWAPHI: Smith-Waterman 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SWAPHI:基于英特尔至强融核的 Smith-Waterman
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商品描述
第一个在共享主机的多个英特尔至强融核协处理器上加速 Smith-Waterman 蛋白质数据库搜索的并行算法。 通过在 UniProtKB/TrEMBL 数据库中进行搜索,SWAPHI 在单个至强融核上实现了高达 58.8 亿每秒单元更新 (GCUPS) 的性能,在四个至强融核上实现了高达 228.4 GCUPS 的性能。
目的
科学/研究、教育、工程
用户界面
.NET/单声道,控制台/终端
程式语言
C++,算法 68
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/swaphi/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。